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分析台灣ST45型耐甲氧西林金黃色葡萄球菌中的異質性萬古黴素抗藥性金黃色...

陳彥璋

分析台灣ST45型耐甲氧西林金黃色葡萄球菌中的異質性萬古黴素抗藥性金黃色葡萄球菌= Analysis of heterogeneous vancomycin-intermediate Staphylococcus aureus in ST45 methicillin-resistant S. aureus isolates from Taiwan/

紀錄類型:	書目-語言資料,印刷品 : Monograph/item
正題名/作者:	分析台灣ST45型耐甲氧西林金黃色葡萄球菌中的異質性萬古黴素抗藥性金黃色葡萄球菌= / 陳彥璋
其他題名:	Analysis of heterogeneous vancomycin-intermediate Staphylococcus aureus in ST45 methicillin-resistant S. aureus isolates from Taiwan/
其他題名:	Analysis of heterogeneous vancomycin-intermediate Staphylococcus aureus in ST45 methicillin-resistant S. aureus isolates from Taiwan
作者:	陳彥璋
出版者:	[高雄市]: [撰者], : 2025[民114],
面頁冊數:	133葉 :圖 ; : 30公分;
附註:	指導教授: 洪薇鈞.
提要註:	背景 ST45型耐甲氧西林金黃色葡萄球菌 (methicillin-resistant Staphylococcus aureus, MRSA)最早於2004年在台灣被發現，主要分為兩大品系: 第一種為本土菌株 (SCCmec ⅤT，spa type t1081，agr Ⅳ )，另一種為外來菌株 (SCCmec Ⅳ，spa type t026，agr Ⅰ )。異質性萬古黴素抗藥性金黃色葡萄球菌 (heterogeneous vancomycin-intermediate S. aureus, hVISA) 的出現率約為10-5至10-6，但由於常規抗生素感受性試驗檢測的限制，使hVISA的鑑定仍具有挑戰性。材料與方法本研究菌株來源為2019至2020年間，自全台五家醫學中心收集之119株ST45 MRSA菌株。最低抑菌濃度 (minimum inhibitory concentrations, MIC) 透過瓊脂稀釋法 (agar dilution) 測定。並進行脈衝場凝膠電泳 (pulsed field gel electrophoresis, PFGE) 與親緣分析進行流行病學剖析。hVISA的篩檢方法包括BHI篩檢試驗 (BHI screen test) 與簡化之群體分析曲線下面積法 (simple population analysis profile-area under the curve, simple PAP-AUC)，疑似hVISA菌株再經過PAP-AUC確認。此外，對兩對經萬古黴素刺激後的母株 / hVISA菌株進行全基因體定序分析。結果在119株ST45 MRSA中，有65.6% 對ciprofloxacin具有抗藥性，57.1% 對tetracycline具有抗藥性，以及3.4% 對rifampin具有抗藥性。PFGE分析顯示菌株可分為25種脈衝型 (pulsotype)，並依agr類型區分為agr Ⅳ (n = 79) 與非agr Ⅳ (n = 40) 兩大群。進一步針對一個臨床個案進行分析，發現患者於vancomycin治療期間，其原始菌株1015轉變為hVISA菌株No.6S，且全基因體定序發現該菌株帶有vraT基因突變。後續針對文獻報導與hVISA相關的10個基因 (包括capP、graSR、rpoB、tcaA、vraTSR、walKR) 進行序列分析，發現ST45菌株之graS基因與其他ST的MRSA存在顯著差異，其胺基酸相似度僅為91.0% 至92.5%。此外，對4株rifampin抗藥性菌株進行rpoB基因定序後，觀察到多個突變位點 (D320N、L466S、D471N、A477D、H481Y、H481N)。由於臨床觀察發現，ST45菌株在vancomycin刺激下會誘發異質抗藥性表現，因此本研究進一步針對13株符合篩檢條件之菌株進行vancomycin誘導試驗，結果發現其中5株菌 (38.5%) 對vancomycin感受性下降，其中4株轉變為hVISA，1株轉變為VISA。針對其中一株hVISA菌株1013-2S與其親代菌株進行全基因體定序，發現1013-2S帶有radA與trmK兩個新型突變。結論台灣ST45 MRSA，無論spa type t1081或t026，其與hVISA形成相關之基因rpoB與graS，各帶有獨特突變位點與序列。本研究揭示ST45經萬古黴素暴露，可轉變為hVISA或VISA，並首次發現與hVISA表現型相關之radA與trmK基因突變。這些結果顯示ST45獨特的基因背景，與發展為hVISA之能力息息相關。.
電子資源:	電子資源
館藏註:	(平裝)

分析台灣ST45型耐甲氧西林金黃色葡萄球菌中的異質性萬古黴素抗藥性金黃色葡萄球菌= Analysis of heterogeneous vancomycin-intermediate Staphylococcus aureus in ST45 methicillin-resistant S. aureus isolates from Taiwan/
陳彥璋

分析台灣ST45型耐甲氧西林金黃色葡萄球菌中的異質性萬古黴素抗藥性金黃色葡萄球菌= Analysis of heterogeneous vancomycin-intermediate Staphylococcus aureus in ST45 methicillin-resistant S. aureus isolates from Taiwan/ Analysis of heterogeneous vancomycin-intermediate Staphylococcus aureus in ST45 methicillin-resistant S. aureus isolates from Taiwan陳彥璋 - [高雄市]: [撰者], 2025[民114] - 133葉 :圖 ;30公分

指導教授: 洪薇鈞.

碩士論文--高雄醫學大學醫學研究所碩士班.

參考書目：葉.

一、研究背景介紹 1-11

背景 ST45型耐甲氧西林金黃色葡萄球菌 (methicillin-resistant Staphylococcus aureus, MRSA)最早於2004年在台灣被發現，主要分為兩大品系: 第一種為本土菌株 (SCCmec ⅤT，spa type t1081，agr Ⅳ )，另一種為外來菌株 (SCCmec Ⅳ，spa type t026，agr Ⅰ )。異質性萬古黴素抗藥性金黃色葡萄球菌 (heterogeneous vancomycin-intermediate S. aureus, hVISA) 的出現率約為10-5至10-6，但由於常規抗生素感受性試驗檢測的限制，使hVISA的鑑定仍具有挑戰性。材料與方法本研究菌株來源為2019至2020年間，自全台五家醫學中心收集之119株ST45 MRSA菌株。最低抑菌濃度 (minimum inhibitory concentrations, MIC) 透過瓊脂稀釋法 (agar dilution) 測定。並進行脈衝場凝膠電泳 (pulsed field gel electrophoresis, PFGE) 與親緣分析進行流行病學剖析。hVISA的篩檢方法包括BHI篩檢試驗 (BHI screen test) 與簡化之群體分析曲線下面積法 (simple population analysis profile-area under the curve, simple PAP-AUC)，疑似hVISA菌株再經過PAP-AUC確認。此外，對兩對經萬古黴素刺激後的母株 / hVISA菌株進行全基因體定序分析。結果在119株ST45 MRSA中，有65.6% 對ciprofloxacin具有抗藥性，57.1% 對tetracycline具有抗藥性，以及3.4% 對rifampin具有抗藥性。PFGE分析顯示菌株可分為25種脈衝型 (pulsotype)，並依agr類型區分為agr Ⅳ (n = 79) 與非agr Ⅳ (n = 40) 兩大群。進一步針對一個臨床個案進行分析，發現患者於vancomycin治療期間，其原始菌株1015轉變為hVISA菌株No.6S，且全基因體定序發現該菌株帶有vraT基因突變。後續針對文獻報導與hVISA相關的10個基因 (包括capP、graSR、rpoB、tcaA、vraTSR、walKR) 進行序列分析，發現ST45菌株之graS基因與其他ST的MRSA存在顯著差異，其胺基酸相似度僅為91.0% 至92.5%。此外，對4株rifampin抗藥性菌株進行rpoB基因定序後，觀察到多個突變位點 (D320N、L466S、D471N、A477D、H481Y、H481N)。由於臨床觀察發現，ST45菌株在vancomycin刺激下會誘發異質抗藥性表現，因此本研究進一步針對13株符合篩檢條件之菌株進行vancomycin誘導試驗，結果發現其中5株菌 (38.5%) 對vancomycin感受性下降，其中4株轉變為hVISA，1株轉變為VISA。針對其中一株hVISA菌株1013-2S與其親代菌株進行全基因體定序，發現1013-2S帶有radA與trmK兩個新型突變。結論台灣ST45 MRSA，無論spa type t1081或t026，其與hVISA形成相關之基因rpoB與graS，各帶有獨特突變位點與序列。本研究揭示ST45經萬古黴素暴露，可轉變為hVISA或VISA，並首次發現與hVISA表現型相關之radA與trmK基因突變。這些結果顯示ST45獨特的基因背景，與發展為hVISA之能力息息相關。.

(平裝)Subjects--Index Terms:

BHI篩檢試驗

分析台灣ST45型耐甲氧西林金黃色葡萄球菌中的異質性萬古黴素抗藥性金黃色葡萄球菌= Analysis of heterogeneous vancomycin-intermediate Staphylococcus aureus in ST45 methicillin-resistant S. aureus isolates from Taiwan/
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500 $a 指導教授: 洪薇鈞.
500 $a 學年度: 113.
502 $a 碩士論文--高雄醫學大學醫學研究所碩士班.
504 $a 參考書目：葉.
505 0 # $a 一、研究背景介紹 1-11
520 3 $a 背景 ST45型耐甲氧西林金黃色葡萄球菌 (methicillin-resistant Staphylococcus aureus, MRSA)最早於2004年在台灣被發現，主要分為兩大品系: 第一種為本土菌株 (SCCmec ⅤT，spa type t1081，agr Ⅳ )，另一種為外來菌株 (SCCmec Ⅳ，spa type t026，agr Ⅰ )。異質性萬古黴素抗藥性金黃色葡萄球菌 (heterogeneous vancomycin-intermediate S. aureus, hVISA) 的出現率約為10-5至10-6，但由於常規抗生素感受性試驗檢測的限制，使hVISA的鑑定仍具有挑戰性。材料與方法本研究菌株來源為2019至2020年間，自全台五家醫學中心收集之119株ST45 MRSA菌株。最低抑菌濃度 (minimum inhibitory concentrations, MIC) 透過瓊脂稀釋法 (agar dilution) 測定。並進行脈衝場凝膠電泳 (pulsed field gel electrophoresis, PFGE) 與親緣分析進行流行病學剖析。hVISA的篩檢方法包括BHI篩檢試驗 (BHI screen test) 與簡化之群體分析曲線下面積法 (simple population analysis profile-area under the curve, simple PAP-AUC)，疑似hVISA菌株再經過PAP-AUC確認。此外，對兩對經萬古黴素刺激後的母株 / hVISA菌株進行全基因體定序分析。結果在119株ST45 MRSA中，有65.6% 對ciprofloxacin具有抗藥性，57.1% 對tetracycline具有抗藥性，以及3.4% 對rifampin具有抗藥性。PFGE分析顯示菌株可分為25種脈衝型 (pulsotype)，並依agr類型區分為agr Ⅳ (n = 79) 與非agr Ⅳ (n = 40) 兩大群。進一步針對一個臨床個案進行分析，發現患者於vancomycin治療期間，其原始菌株1015轉變為hVISA菌株No.6S，且全基因體定序發現該菌株帶有vraT基因突變。後續針對文獻報導與hVISA相關的10個基因 (包括capP、graSR、rpoB、tcaA、vraTSR、walKR) 進行序列分析，發現ST45菌株之graS基因與其他ST的MRSA存在顯著差異，其胺基酸相似度僅為91.0% 至92.5%。此外，對4株rifampin抗藥性菌株進行rpoB基因定序後，觀察到多個突變位點 (D320N、L466S、D471N、A477D、H481Y、H481N)。由於臨床觀察發現，ST45菌株在vancomycin刺激下會誘發異質抗藥性表現，因此本研究進一步針對13株符合篩檢條件之菌株進行vancomycin誘導試驗，結果發現其中5株菌 (38.5%) 對vancomycin感受性下降，其中4株轉變為hVISA，1株轉變為VISA。針對其中一株hVISA菌株1013-2S與其親代菌株進行全基因體定序，發現1013-2S帶有radA與trmK兩個新型突變。結論台灣ST45 MRSA，無論spa type t1081或t026，其與hVISA形成相關之基因rpoB與graS，各帶有獨特突變位點與序列。本研究揭示ST45經萬古黴素暴露，可轉變為hVISA或VISA，並首次發現與hVISA表現型相關之radA與trmK基因突變。這些結果顯示ST45獨特的基因背景，與發展為hVISA之能力息息相關。.
520 3 $a Background ST45 methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) was first identified in Taiwan in 2004 with two main lineages: a domestic strain (SCCmec ⅤT, spa type t1081, agr Ⅳ ) and an imported strain (SCCmec Ⅳ, spa type t026, agr Ⅰ ). Heterogeneous vancomycin-intermediate S. aureus (hVISA) occurrence ranges from 10-5 to 10-6, but its detection is challenging due to limitations of routine antimicrobial susceptibility testing. Materials & Methods A total of 119 ST45 MRSA isolates were previously collected from five medical centers across Taiwan between 2019 and 2020. Minimum inhibitory concentrations (MICs) were determined via the agar dilution method. Pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) followed by phylogenetic relationship construction were performed for epidemiological analysis. hVISA was screened using the BHI screen test and simple population analysis profile-area under the curve (simple PAP-AUC). Suspected hVISA strains were confirmed by PAP-AUC, and two pairs of parent strains / hVISA after vancomycin stimulation were further analyzed by whole-genome sequencing. Results Of the 119 ST45 MRSA isolates, 65.6% were resistant to ciprofloxacin, 57.1% to tetracycline, and 3.4% to rifampin. PFGE analysis revealed 25 distinct pulsotypes and classified isolates into two major groups based on agr type: agr Ⅳ (n = 79) and non-agr Ⅳ (n = 40). A clinical case analysis showed that the patient’s original isolate (1015) evolved into an hVISA strain (No.6S) during vancomycin treatment, with whole-genome sequencing revealing a mutation in the vraT gene. Further sequence analysis of 10 genes previously associated with hVISA (including capP, graSR, rpoB, tcaA, vraTSR, and walKR) showed that graS in ST45 isolates exhibited significant divergence from other MRSA sequence types, with amino acid identity ranging from 91.0% to 92.5%. rpoB sequencing of four rifampin-resistant isolates revealed multiple mutations (D320N, L466S, D471N, A477D, H481Y, and H481N). Based on clinical and laboratory findings, ST45 strains appeared more likely to develop heteroresistance upon vancomycin exposure. Thirteen isolates meeting screening criteria were subjected to vancomycin induction, and five (38.5%) showed reduced susceptibility, including that four hVISA and one evolved into VISA. Whole-genome sequencing of one hVISA strain (1013-2S) and its parent isolate identified novel mutations in radA and trmK. Conclusion In Taiwan, ST45 MRSA strains, regardless of spa type t1081 or t026, harbored unique mutation sites and sequences in the rpoB and graS genes associated with hVISA development. The current study demonstrated that ST45 can transition into hVISA or VISA upon vancomycin exposure. Moreover, novel mutations in the radA and trmK genes associated with the hVISA phenotype were identified for the first time. These findings highlight the distinct genetic background of ST45 and its potential link to the ability to evolve into hVISA..
563 $a (平裝)
653 # # $a BHI篩檢試驗 $a 序列類型45 $a 異質性萬古黴素抗藥性金黃色葡萄球菌 $a 耐甲氧西林金黃色葡萄球菌 $a 金黃色葡萄球菌 $a 群體分析曲線下面積法 $a 脈衝場凝膠電泳 $a 全基因體定序.
653 # # $a Population analysis profile-area under the curve $a BHI screen test $a ST45 $a hVISA $a Heterogeneous vancomycin-intermediate Staphylococcus aureus $a MRSA $a Methicillin-resistant Staphylococcus aureus $a Staphylococcus aureus $a PAP-AUC $a Pulsed-field gel electrophoresis $a Whole genome sequencing.
856 7 # $u https://handle.ncl.edu.tw/11296/27s6vs $z 電子資源 $2 http